以前教會是自己記帳，同時自己辦理結算申報，後來經會計師告知，財產總額或當年度收入總額達新台幣一億元以上者，須開始委託會計師作查核簽證申報。
依據教育文化公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準第二條規定，財產總額或當年度收入總額達新台幣一億元以上之教會，須委託經財政部核淮為稅務代理人之會計師作查核簽證申報；否則，即不符合「免稅標準」之規定。